土地增值税是指在土地使用权转让中，因土地增值而应纳交的税款，其计算方法如下：
1、确定土地增值税的应纳税额：应纳税额是指土地增值税按照所得额和税率计算得出的税额。
计算公式：应纳税额 = （土地转让价款 - 取得土地时的成本价值 - 土地增值税预征税款）× 税率
其中，土地转让价款是指土地使用权转让的价值，成本价值是指取得土地时的成本，土地增值税预征税款是指已经预征的土地增值税款。
2、缴纳土地增值税：土地增值税应当在土地使用权转让时一次性缴纳。纳税人需要在规定的时间内进行申报并缴纳土地增值税。
需要注意的是，不同地区的土地增值税计算方式可能会有所不同，具体计算标准应按照当地政策规定进行。